Негосударственная пенсия выплачивается исходя из суммы, накопленной вкладчиком на индивидуальном пенсионном счете в Негосударственном  пенсионном фонде. Накопленная сумма складывается из пенсионных взносов, уплаченных вкладчиком лично или юридическим лицом в его пользу, и инвестиционного дохода, полученного НПФ по результатам размещения пенсионных резервов. 

НПФ «Система» предлагает различные корпоративные пенсионные программы и индивидуальные пенсионные планы. Дополнительная (негосударственная) пенсия выплачивает Фондом пожизненно или на протяжении определенного количества лет (от 3 до 15 лет), в зависимости от выбранной пенсионной схемы. Порядок внесения взносов и выплаты пенсии устанавливаются в договоре о негосударственном пенсионном обеспечении.

Вкладчик может в любой момент расторгнуть договор о негосударственном пенсионном обеспечении и забрать либо перевести в другой НПФ выкупную сумму.

Основные пенсионные схемы описаны в Пенсионных правилах НПФ "Система".